RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548524.5

USP15-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, human

TSL 2

Gene USP15, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP15-208	ENST00000548524	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.01	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	YDJC	A8MPS7	323 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	EPS15	P42566	896 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	HTRA3	P83110	453 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	FOXO4	P98177	505 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	STK24	Q9Y6E0	443 aa		12	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	PSMD14	O00487	310 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	COL4A1	P02462	1669 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	KCNJ4	P48050	445 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524		H7C1D1	291 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	CHRND	Q07001	517 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	DPF2	Q92785	391 aa		11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.96	□□□□□ -0.49
USP15-208	ENST00000548524	TAF1	P21675	1872 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	UTY	O14607	1347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	PLIN1	O60240	522 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TAF5L	O75529	589 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	SCN4A	P35499	1836 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TIE1	P35590	1138 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	SNAP23	O00161	211 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	KLRK1	P26718	216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	TRAF5	O00463	557 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP15-208	ENST00000548524	BCAR3	O75815	825 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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