RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546125.1

KNTC1-215, Transcript of kinetochore associated 1, human

TSL 5

Gene KNTC1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KNTC1-215	ENST00000546125		Q8N3U1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	NDUFB5	O43674	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	BRD1	O95696	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	OSMR	Q99650	979 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	DLL1	O00548	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	PTPRA	P18433	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	NFKBIE	O00221	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	ALX3	O95076	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	EDN3	P14138	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KNTC1-215	ENST00000546125	FSCN2	O14926	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	NEFL	P07196	543 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	EPHA1	P21709	976 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	NOS3	P29474	1203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	CABP4	P57796	275 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	ORC1	Q13415	861 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125		A0A1W2PP55	124 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125		H3BRJ5	948 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	WISP1	O95388	367 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	GLB1	P16278	677 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	ARL4D	P49703	201 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KNTC1-215	ENST00000546125	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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