RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545450.6

MSLN-202, Transcript of mesothelin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSLN, Length 2,162 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-202ENST00000545450 PTH1RQ03431 593 aa22.24■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.24■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.24■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.23■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.23■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 TNNI3KQ59H18 835 aa22.23■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.23■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 FAM177BA6PVY3 158 aa22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CAMTA2O94983 1202 aa22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 EP400Q96L91 3159 aa22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ME3Q16798 604 aa22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 NECTIN1Q15223 517 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 SPC24Q8NBT2 197 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 LY75O60449 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ELP1O95163 1332 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CSF1RP07333 972 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 LRRC24Q50LG9 513 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 ANKRD7Q92527 254 aa22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MSLN-202ENST00000545450 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 TTC6Q86TZ1 520 aa22.2■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 ATP2B3Q16720 1220 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 EYA2O00167 538 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 KRT85P78386 507 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 MAP3K11Q16584 847 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.19■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 DTNBO60941 627 aa22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CBX1P83916 185 aa22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.18■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CIAO1O76071 339 aa22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 TYRO3Q06418 890 aa22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 SUSD4Q5VX71 490 aa22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 NECAB1Q8N987 351 aa22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 LIG1P18858 919 aa22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CTSWP56202 376 aa22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 PTGS1P23219 599 aa22.16■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 EVI5LQ96CN4 794 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 GREM2Q9H772 168 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 SCN7AQ01118 1682 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 ZNF609O15014 1411 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 PDCP20941 246 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 SMIM5Q71RC9 77 aa22.15■■□□□ 1.14
MSLN-202ENST00000545450 PDE8AO60658 829 aa22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 LUZP1Q86V48 1076 aa22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 MAP4K1Q92918 833 aa22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 LAMB2P55268 1798 aa22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 GPR108Q9NPR9 543 aa22.14■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ATP5JP18859 108 aa22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ITGA6P23229 1130 aa22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CAMK4Q16566 473 aa22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CBX8Q9HC52 389 aa22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SNRKQ9NRH2 765 aa22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 PSMA5P28066 241 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 TIMM10P62072 90 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 FBXO3Q9UK99 471 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 PARP10Q53GL7 1025 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 FERMT3Q86UX7 667 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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