RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.69■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.69■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 OGFOD1Q8N543 542 aa26.69■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 MXD3Q9BW11 206 aa26.69■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.69■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.68■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 GREM2Q9H772 168 aa26.68■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 NF2P35240 595 aa26.67■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.67■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.66■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 SASH1O94885 1247 aa26.66■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.66■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 STK31Q9BXU1 1019 aa26.66■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.66■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 TBC1D8O95759 1140 aa26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 DACT2Q5SW24 774 aa26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 KSR2Q6VAB6 950 aa26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 IGKV5-2P06315 115 aa26.64■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
RHBDD1-215ENST00000539613 WNT10BO00744 389 aa26.63■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.63■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 TSPYL6Q8N831 410 aa26.63■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.63■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 PRKG1Q13976 671 aa26.62■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 COA1Q9GZY4 146 aa26.62■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.62■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.61■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.6■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 KCNJ4P48050 445 aa26.6■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.6■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 A0A1B0GUL6 1792 aa26.6■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 SREBF2Q12772 1141 aa26.59■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.59■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.59■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 KLRK1P26718 216 aa26.58■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.58■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.58■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.58■■□□□ 1.85
RHBDD1-215ENST00000539613 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.57■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 ITGA6P23229 1130 aa26.56■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.56■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 GPR25O00155 361 aa26.55■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 GTF2IP78347 998 aa26.55■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 TM4SF4P48230 202 aa26.54■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 G2E3Q7L622 706 aa26.54■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 CACNA1FO60840 1977 aa26.53■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 H7C1W4 665 aa26.52■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC4A2P04920 1241 aa26.52■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.52■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 FZD1Q9UP38 647 aa26.52■■□□□ 1.84
RHBDD1-215ENST00000539613 FKTNO75072 461 aa26.51■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 MMP14P50281 582 aa26.51■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 GCKRQ14397 625 aa26.51■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 CHRNDQ07001 517 aa26.5■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 DLGAP5Q15398 846 aa26.5■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.5■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 LAMB1P07942 1786 aa26.49■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 FLIIQ13045 1269 aa26.49■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.49■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.49■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 F8W031 263 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 SPRYD7Q5W111 196 aa26.48■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.48■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 CD209Q9NNX6 404 aa26.48■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.47■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.47■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.47■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.46■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.46■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 OTOFQ9HC10 1997 aa26.46■■□□□ 1.83
RHBDD1-215ENST00000539613 CLRN2A0PK11 232 aa26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 SNAP23O00161 211 aa26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 MYO1BO43795 1136 aa26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 TAF5LO75529 589 aa26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 ALDH1A1P00352 501 aa26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
RHBDD1-215ENST00000539613 VEZTQ9HBM0 779 aa26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms