RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	COA1	Q9GZY4	146 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	ECE1	P42892	770 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	CAPNS2	Q96L46	248 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	SPEF2	Q9C093	1822 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	CAPN15	O75808	1086 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	USP17L8	P0C7I0	530 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	DLK2	Q6UY11	383 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCN9A	Q15858	1988 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	FOXN1	O15353	648 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	TAF5L	O75529	589 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	KLRK1	P26718	216 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	TNS4	Q8IZW8	715 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	GML	Q99445	158 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADM5	C9JUS6	153 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	MXD3	Q9BW11	206 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	WBP1L	Q9NX94	342 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	GGA3	Q9NZ52	723 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	PTPRC	P08575	1304 aa		31.51	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF609	O15014	1411 aa		31.51	■■■□□ 2.64
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCARF1	Q14162	830 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	DACT2	Q5SW24	774 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	SULF1	Q8IWU6	871 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	SNAP23	O00161	211 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLIN1	O60240	522 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	GTF2I	P78347	998 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	AOC2	O75106	756 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	HUNK	P57058	714 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	CD209	Q9NNX6	404 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PTPRJ-206	ENST00000534219	UTY	O14607	1347 aa		31.45	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAP2K2	P36507	400 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	CDCA5	Q96FF9	252 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	LBX1	P52954	281 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	PSME4	Q14997	1843 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTPRJ-206	ENST00000534219	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	MMP14	P50281	582 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	USP44	Q9H0E7	712 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	WNT10B	O00744	389 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	SASH1	O94885	1247 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	IL1R1	P14778	569 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	RGMB	Q6NW40	437 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBE4A	Q14139	1066 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	NOG	Q13253	232 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PTPRJ-206	ENST00000534219	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	CERS5	Q8N5B7	392 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	LRRC24	Q50LG9	513 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	METTL24	Q5JXM2	366 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC102A	Q96A19	550 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PTPRJ-206	ENST00000534219	GYG1	P46976	350 aa		31.3	■■■□□ 2.6

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