RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 GCKRQ14397 625 aa29.22■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 FBXW7Q969H0 707 aa29.22■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 CCDC102AQ96A19 550 aa29.22■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.21■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.21■■■□□ 2.27
PKP3-210ENST00000533249 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.2■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 MXD3Q9BW11 206 aa29.2■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 ITGA6P23229 1130 aa29.19■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 FAM161AQ3B820 660 aa29.19■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.19■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.18■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.18■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 CASP7P55210 303 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 DACT2Q5SW24 774 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 LINS1Q8NG48 757 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 COA1Q9GZY4 146 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.17■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 SLC10A3P09131 477 aa29.16■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.16■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 VAMP4O75379 141 aa29.15■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.15■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.15■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.15■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 CACNA1FO60840 1977 aa29.14■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 KLRK1P26718 216 aa29.14■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 DGKZQ13574 1117 aa29.14■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.14■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 OGFOD1Q8N543 542 aa29.14■■■□□ 2.26
PKP3-210ENST00000533249 ANP32CO43423 234 aa29.13■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 CSF1RP07333 972 aa29.13■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 WDR63Q8IWG1 891 aa29.13■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.13■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.12■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 TRPA1O75762 1119 aa29.12■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 KCNJ4P48050 445 aa29.12■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.12■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 FKBP1BP68106 108 aa29.11■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 MOB2Q70IA6 237 aa29.11■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.11■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 RNF186Q9NXI6 227 aa29.11■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.11■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.1■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.1■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 F6X3S4 739 aa29.1■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 CHRNDQ07001 517 aa29.1■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.1■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 CSRNP1Q96S65 589 aa29.1■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 WNT10BO00744 389 aa29.09■■■□□ 2.25
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PKP3-210ENST00000533249 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.08■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.08■■■□□ 2.25
PKP3-210ENST00000533249 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.07■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 SNAP23O00161 211 aa29.06■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 FOXO4P98177 505 aa29.06■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 TAF5LO75529 589 aa29.05■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 BEND3Q5T5X7 828 aa29.05■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.05■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 CD209Q9NNX6 404 aa29.04■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 NF2P35240 595 aa29.03■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 MMP14P50281 582 aa29.02■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PKP3-210ENST00000533249 A0A1B0GUL6 1792 aa29.01■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.01■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.01■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 RGS19P49795 217 aa29■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.99■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 GRM8O00222 908 aa28.99■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 PRKG1Q13976 671 aa28.99■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.98■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.98■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 CERS5Q8N5B7 392 aa28.98■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 PLIN1O60240 522 aa28.97■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 DLGAP5Q15398 846 aa28.97■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.97■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.97■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PKP3-210ENST00000533249 F8W031 263 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
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