RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532557.5

MDP1-208, Transcript of magnesium dependent phosphatase 1, human

TSL 2

Gene MDP1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDP1-208	ENST00000532557	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	GPSM2	P81274	684 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	SEMA3E	O15041	775 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	RGS3	P49796	1198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	TIMM10	P62072	90 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	PSMD1	Q99460	953 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	IGSF3	O75054	1194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	UFL1	O94874	794 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	ADORA1	P30542	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	KCNJ4	P48050	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	MPND	Q8N594	471 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	PSME4	Q14997	1843 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	EYA3	Q99504	573 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	HAUS7	Q99871	368 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	SNAP23	O00161	211 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	KLRK1	P26718	216 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	PHKA1	P46020	1223 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	MYH7	P12883	1935 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MDP1-208	ENST00000532557	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	C21orf2	O43822	256 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	IL1R1	P14778	569 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	MCAM	P43121	646 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	SDS	P20132	328 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	GYG1	P46976	350 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	BCAM	P50895	628 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	CHD4	Q14839	1912 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	SCARF1	Q14162	830 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	COL4A5	P29400	1685 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MDP1-208	ENST00000532557	NFKBIE	O00221	500 aa		11.05	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms