RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 MED23Q9ULK4 1368 aa18.35■□□□□ 0.53
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UBASH3B-202ENST00000525711 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
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UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 FKTNO75072 461 aa18.33■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.32■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 WNT10BO00744 389 aa18.31■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.3■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 CTSWP56202 376 aa18.29■□□□□ 0.52
UBASH3B-202ENST00000525711 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 SASH1O94885 1247 aa18.28■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 INHBEP58166 350 aa18.27■□□□□ 0.52
UBASH3B-202ENST00000525711 MXD3Q9BW11 206 aa18.27■□□□□ 0.52
UBASH3B-202ENST00000525711 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
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UBASH3B-202ENST00000525711 GNAI1P63096 354 aa18.26■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 SPRYD7Q5W111 196 aa18.26■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 IFT57Q9NWB7 429 aa18.26■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.26■□□□□ 0.51
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UBASH3B-202ENST00000525711 HTTP42858 3142 aa18.26■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GUL6 1792 aa18.25■□□□□ 0.51
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UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.25■□□□□ 0.51
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UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM17Q9Y577 477 aa18.25■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.24■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.24■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.24■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 CACNA1FO60840 1977 aa18.24■□□□□ 0.51
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UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.23■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 KSR2Q6VAB6 950 aa18.22■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.22■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 IFNL1Q8IU54 200 aa18.22■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 ERO1AQ96HE7 468 aa18.22■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.22■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 OTOFQ9HC10 1997 aa18.22■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNJ4P48050 445 aa18.21■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 GTF2IP78347 998 aa18.21■□□□□ 0.51
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UBASH3B-202ENST00000525711 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.21■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.21■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.21■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.21■□□□□ 0.51
UBASH3B-202ENST00000525711 BRCA2P51587 3418 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 UNCXA6NJT0 531 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO1BO43795 1136 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV5-2P06315 115 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 MAP3K11Q16584 847 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 WNK4Q96J92 1243 aa18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.19■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 STK31Q9BXU1 1019 aa18.19■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.18■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 POTEFA5A3E0 1075 aa18.18■□□□□ 0.5
UBASH3B-202ENST00000525711 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.18■□□□□ 0.5
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