RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 EGFRP00533 1210 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 GMLQ99445 158 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 KIF16BQ96L93 1317 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 KCNJ4P48050 445 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 JMYQ8N9B5 988 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 BCAR3O75815 825 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 DACT2Q5SW24 774 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 TRAF5O00463 557 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 PLIN1O60240 522 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 MXD3Q9BW11 206 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 CD209Q9NNX6 404 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 LRRC24Q50LG9 513 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 TNNQ9UQP3 1299 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 CNTNAP1P78357 1384 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 USP17L8P0C7I0 530 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 TRIM27P14373 513 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 CST9Q5W186 159 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 FBXW7Q969H0 707 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 UBE4AQ14139 1066 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 IL1R1P14778 569 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 GTF2IP78347 998 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 MEIS3Q99687 375 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 USP48Q86UV5 1035 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 RASSF10A6NK89 507 aa22.21■■□□□ 1.15
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TSNARE1-207ENST00000521825 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-207ENST00000521825 SCARF1Q14162 830 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 METTL24Q5JXM2 366 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 DLK2Q6UY11 383 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 PDE8BO95263 885 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 GYG1P46976 350 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 CERS5Q8N5B7 392 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 GGA3Q9NZ52 723 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 PCNTO95613 3336 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 EYA2O00167 538 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 VEGFBP49765 207 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ADM5C9JUS6 153 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 GNAI3P08754 354 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 MMP14P50281 582 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 OGFOD1Q8N543 542 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 SASH1O94885 1247 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-207ENST00000521825 WNT10BO00744 389 aa22.15■■□□□ 1.14
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