RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519645.5

HACE1-210, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 5

Gene HACE1, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-210ENST00000519645 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 KLRG1Q96E93 195 aa29.79■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.78■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.78■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 FBXW7Q969H0 707 aa29.77■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
HACE1-210ENST00000519645 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.76■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.76■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.75■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.74■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 SCN9AQ15858 1988 aa29.74■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.74■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.74■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.74■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 ZNF609O15014 1411 aa29.73■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 EGFRP00533 1210 aa29.73■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 TRIM27P14373 513 aa29.73■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 DACT2Q5SW24 774 aa29.73■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.73■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 GMLQ99445 158 aa29.73■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.72■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 TRAF5O00463 557 aa29.72■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 USP17L8P0C7I0 530 aa29.72■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.72■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 CD209Q9NNX6 404 aa29.72■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 UBE4AQ14139 1066 aa29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 LRRC24Q50LG9 513 aa29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 MEIS3Q99687 375 aa29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.71■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 METTL24Q5JXM2 366 aa29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 MXD3Q9BW11 206 aa29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
HACE1-210ENST00000519645 GTF2IP78347 998 aa29.69■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.69■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 TNNQ9UQP3 1299 aa29.69■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 GNAI3P08754 354 aa29.68■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 OGFOD1Q8N543 542 aa29.68■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.67■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 IL1R1P14778 569 aa29.66■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 JMYQ8N9B5 988 aa29.66■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 USP48Q86UV5 1035 aa29.65■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 EYA2O00167 538 aa29.64■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 PDE8BO95263 885 aa29.64■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.64■■■□□ 2.34
HACE1-210ENST00000519645 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 GYG1P46976 350 aa29.63■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 SCARF1Q14162 830 aa29.63■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 CST9Q5W186 159 aa29.63■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 PSME4Q14997 1843 aa29.63■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 CNTNAP1P78357 1384 aa29.63■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 A0A1B0GUL6 1792 aa29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 PCNTO95613 3336 aa29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 GGA3Q9NZ52 723 aa29.62■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 MMP14P50281 582 aa29.61■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 VPS37DQ86XT2 251 aa29.61■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 SIL1Q9H173 461 aa29.61■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.61■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.61■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 SULF1Q8IWU6 871 aa29.6■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.6■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 RASSF10A6NK89 507 aa29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 SASH1O94885 1247 aa29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 FBXO3Q9UK99 471 aa29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 JAG2Q9Y219 1238 aa29.59■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 ADM5C9JUS6 153 aa29.58■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 GNAI2P04899 355 aa29.58■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.58■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
HACE1-210ENST00000519645 CIAO1O76071 339 aa29.57■■■□□ 2.32
HACE1-210ENST00000519645 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
HACE1-210ENST00000519645 DLK2Q6UY11 383 aa29.57■■■□□ 2.32
HACE1-210ENST00000519645 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms