RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLVS1-204ENST00000518858 COL18A1P39060 1754 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-204ENST00000518858 VAMP4O75379 141 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLVS1-204ENST00000518858 TTC6Q86TZ1 520 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLVS1-204ENST00000518858 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CLVS1-204ENST00000518858 GNAI3P08754 354 aa9.52□□□□□ -0.88
CLVS1-204ENST00000518858 CHMLP26374 656 aa9.52□□□□□ -0.88
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CLVS1-204ENST00000518858 ZNF428Q96B54 188 aa9.52□□□□□ -0.88
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CLVS1-204ENST00000518858 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.52□□□□□ -0.89
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