RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517947.5

G3BP1-204, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene G3BP1, Length 558 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-204ENST00000517947 AIDAQ96BJ3 306 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 MED23Q9ULK4 1368 aa14.72□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 SCN9AQ15858 1988 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 USP17L8P0C7I0 530 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 ECE1P42892 770 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 KCNJ4P48050 445 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 CHRNDQ07001 517 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 SLFN5Q08AF3 891 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 CAPNS2Q96L46 248 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 COA1Q9GZY4 146 aa14.71□□□□□ -0.05
G3BP1-204ENST00000517947 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 FOXN1O15353 648 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 DLK2Q6UY11 383 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 FBXW7Q969H0 707 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 GMLQ99445 158 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 WBP1LQ9NX94 342 aa14.7□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SPEF2Q9C093 1822 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 TAF5LO75529 589 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 TNS4Q8IZW8 715 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.69□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CCER2I3L3R5 266 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 KLRK1P26718 216 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SCARF1Q14162 830 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 DACT2Q5SW24 774 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SULF1Q8IWU6 871 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 MXD3Q9BW11 206 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 GGA3Q9NZ52 723 aa14.68□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 ADM5C9JUS6 153 aa14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SNAP23O00161 211 aa14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 OGFOD1Q8N543 542 aa14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.67□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 PTPRCP08575 1304 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 ZNF609O15014 1411 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 PLIN1O60240 522 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 MAP2K2P36507 400 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 SUCLG2Q96I99 432 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 AOC2O75106 756 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CAPN15O75808 1086 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 HUNKP57058 714 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 GTF2IP78347 998 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 KAZALD1Q96I82 304 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 CD209Q9NNX6 404 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 UTYO14607 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-204ENST00000517947 LBX1P52954 281 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 PSME4Q14997 1843 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 MMP14P50281 582 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 CDCA5Q96FF9 252 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 USP44Q9H0E7 712 aa14.62□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.62□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.62□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 WNT10BO00744 389 aa14.61□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 IL1R1P14778 569 aa14.61□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 NOGQ13253 232 aa14.61□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
G3BP1-204ENST00000517947 RGMBQ6NW40 437 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms