RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 TNNI2P48788 182 aa6.8□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.8□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 C8orf34Q49A92 452 aa6.8□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.8□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 FAM83GA6ND36 823 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 BBOX1O75936 387 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 DDX11Q96FC9 970 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 HAUS7Q99871 368 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.79□□□□□ -1.32
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POLK-215ENST00000514141 GPS2Q13227 327 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 USP26Q9BXU7 913 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 GINM1Q9NU53 330 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MYO6Q9UM54 1294 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 SHPRHQ149N8 1683 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.79□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 TNS2Q63HR2 1409 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 IGHDP01880 384 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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POLK-215ENST00000514141 CNKSR1Q969H4 720 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CABP5Q9NP86 173 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ZMYM6O95789 1325 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MSH5O43196 834 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
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POLK-215ENST00000514141 HSPA4P34932 840 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MCTP1Q6DN14 999 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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POLK-215ENST00000514141 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.78□□□□□ -1.32
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POLK-215ENST00000514141 CHRNA2Q15822 529 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 C8orf76Q96K31 380 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 SPATA32Q96LK8 384 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 USP21Q9UK80 565 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 LRRC37A3O60309 1634 aa6.78□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 BAG6P46379 1132 aa6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MAP3K11Q16584 847 aa6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 TSPYL6Q8N831 410 aa6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CNBD1Q8NA66 436 aa6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 USP44Q9H0E7 712 aa6.77□□□□□ -1.32
POLK-215ENST00000514141 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
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POLK-215ENST00000514141 F6X3S4 739 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 RPS6KA4O75676 772 aa6.77□□□□□ -1.33
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POLK-215ENST00000514141 ZBTB22O15209 634 aa6.77□□□□□ -1.33
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POLK-215ENST00000514141 ALX1Q15699 326 aa6.77□□□□□ -1.33
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POLK-215ENST00000514141 STX6O43752 255 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 ERMNQ8TAM6 284 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 VPS33BQ9H267 617 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 SWAP70Q9UH65 585 aa6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.76□□□□□ -1.33
POLK-215ENST00000514141 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.76□□□□□ -1.33
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