RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513985.5

ZNF608-208, Transcript of zinc finger protein 608, human

TSL 1 (best)

Gene ZNF608, Length 1,539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF608-208	ENST00000513985	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	CACNA1S	Q13698	1873 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	TAF1	P21675	1872 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	GPR162	Q16538	588 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	FAM161A	Q3B820	660 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	BCS1L	Q9Y276	419 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	CHD4	Q14839	1912 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	UTY	O14607	1347 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	MYH3	P11055	1940 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	NPHP1	O15259	732 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	OAT	P04181	439 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	CNKSR1	Q969H4	720 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	ABCC4	O15439	1325 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	SBF1	O95248	1867 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	PRELP	P51888	382 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	NFKBIE	O00221	500 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	PDE8A	O60658	829 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	CSF1R	P07333	972 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	TRIM27	P14373	513 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF608-208	ENST00000513985	GRM8	O00222	908 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	ALDH1B1	P30837	517 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	OLFM4	Q6UX06	510 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	C21orf2	O43822	256 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	CTSW	P56202	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	FOXO4	P98177	505 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	GRAP	Q13588	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	PLCG2	P16885	1265 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	BBOX1	O75936	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	GREM2	Q9H772	168 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	SLC34A2	O95436	690 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	RLBP1	P12271	317 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	RASSF7	Q02833	373 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	PDE4C	Q08493	712 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	SOGA3	Q5TF21	947 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF608-208	ENST00000513985	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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