RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512553.5

ITGA3-213, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-213ENST00000512553 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 USP17L8P0C7I0 530 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 MAP2K2P36507 400 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 TNS4Q8IZW8 715 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CAPNS2Q96L46 248 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 F6X3S4 739 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CA12O43570 354 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CST9Q5W186 159 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 WBP1LQ9NX94 342 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 GGA3Q9NZ52 723 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CHRNDQ07001 517 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SHTN1A0MZ66 631 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 FOXN1O15353 648 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 FKBP1BP68106 108 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 FOXO4P98177 505 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 NOGQ13253 232 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 USP48Q86UV5 1035 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 FBXW7Q969H0 707 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 GMLQ99445 158 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 UTYO14607 1347 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 HUNKP57058 714 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SLFN5Q08AF3 891 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 DACT2Q5SW24 774 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 NF2P35240 595 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 GRM1Q13255 1194 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 SCARF1Q14162 830 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 CCDC102AQ96A19 550 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 ADM5C9JUS6 153 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 EGFRP00533 1210 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 UBE4AQ14139 1066 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 CD209Q9NNX6 404 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 IL1R1P14778 569 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 RGMBQ6NW40 437 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 CDCA5Q96FF9 252 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 KIF16BQ96L93 1317 aa11.81□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 MYO1BO43795 1136 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 LBX1P52954 281 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 GTF2IP78347 998 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 SUCLG2Q96I99 432 aa11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 WNT10BO00744 389 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 TAF5LO75529 589 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 KLRK1P26718 216 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.79□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 PLIN1O60240 522 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 AOC2O75106 756 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 DLGAP5Q15398 846 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 VPS37DQ86XT2 251 aa11.78□□□□□ -0.52
ITGA3-213ENST00000512553 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms