RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFT57Q9NWB7 429 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL4A1P02462 1669 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPR25O00155 361 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TBC1D8O95759 1140 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALDH1A1P00352 501 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GCC1Q96CN9 775 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COA1Q9GZY4 146 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WNT10BO00744 389 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FKTNO75072 461 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF853P0CG23 659 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DACT2Q5SW24 774 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 INHBEP58166 350 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MOB2Q70IA6 237 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STK31Q9BXU1 1019 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SASH1O94885 1247 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNJ4P48050 445 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KSR2Q6VAB6 950 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GREM2Q9H772 168 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UNCXA6NJT0 531 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYO1BO43795 1136 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRKG1Q13976 671 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DLGAP5Q15398 846 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPRYD7Q5W111 196 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYH3P11055 1940 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 APAF1O14727 1248 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGKV5-2P06315 115 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MXD3Q9BW11 206 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GTF2IP78347 998 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERO1AQ96HE7 468 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM17Q9Y577 477 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPEF2Q9C093 1822 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ITGA6P23229 1130 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP3K11Q16584 847 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFNL1Q8IU54 200 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 H7C1W4 665 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGEF6Q15052 776 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WNK4Q96J92 1243 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CD209Q9NNX6 404 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHRNDQ07001 517 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNFAIP1Q13829 316 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GCKRQ14397 625 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC4A2P04920 1241 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms