RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 HPS1Q92902 700 aa7.08□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 RUBCNLQ9H714 662 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.08□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 MMP20O60882 483 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 GPAMQ9HCL2 828 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.07□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 ENC1O14682 589 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 NKD1Q969G9 470 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 ZFATQ9P243 1243 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 TNFRSF10AO00220 468 aa7.05□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 TRPA1O75762 1119 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 BMP2P12643 396 aa7.05□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.05□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 FBXO27Q8NI29 283 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 FANCLQ9NW38 375 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 METTL12A8MUP2 240 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 CDC45O75419 566 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 PAGE1O75459 146 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 UPP2O95045 317 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 KIF4AO95239 1232 aa7.04□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 HHIPQ96QV1 700 aa7.04□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 ESYT3A0FGR9 886 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 CHMP4BP1P59074 171 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 DDR2Q16832 855 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC3-209ENST00000504994 FAAP100Q0VG06 881 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 NLRP8Q86W28 1048 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 ST7Q9NRC1 585 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 EFSO43281 561 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 NFKB1P19838 968 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 GIPRP48546 466 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-209ENST00000504994 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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