RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 FLT4P35916 1363 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIK3C2AO00443 1686 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXC9P31274 260 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 EVA1CP58658 441 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 GMCL1Q96IK5 515 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP3Q96P20 1036 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.19□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PXDNQ92626 1479 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 BCRP11274 1271 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL13P35225 146 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCAF5Q96JK2 942 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 APAF1O14727 1248 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 HMOX1P09601 288 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHKA2P46019 1235 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CENPCQ03188 943 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF20Q5VTR2 975 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNKSR1Q969H4 720 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPAMQ9HCL2 828 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP19O94966 1318 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALS2Q96Q42 1657 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHLPP1O60346 1717 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 F11P03951 625 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 YY1P25490 414 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHRNA2Q15822 529 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTL1A6NKG5 1358 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP54Q70EL1 1684 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 LTN1O94822 1766 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 H7C1W4 665 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 MX2P20592 715 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRKAR2BP31323 418 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIPK4P57078 832 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR44Q5JSH3 913 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC125Q86Z20 511 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 BANK1Q8NDB2 785 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRBNQ96SW2 442 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF521Q96K83 1311 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM83GA6ND36 823 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 OIP5O43482 229 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLIT3O75094 1523 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNRH1P01148 92 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHA1P01876 353 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 PROCP04070 461 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA0232Q92628 1395 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 STRN4Q9NRL3 753 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.14□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPDO75976 1380 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 JCADQ9P266 1359 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLIN1O60240 522 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLFN5Q08AF3 891 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 C4orf17Q53FE4 359 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 XAGE2Q96GT9 111 aa7.13□□□□□ -1.27
ARHGEF3-215ENST00000498517 NGLY1Q96IV0 654 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms