RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498439.1

CHTF18-213, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-213ENST00000498439 NF2P35240 595 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 DGKZQ13574 1117 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 GREM2Q9H772 168 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 SCN9AQ15858 1988 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 PSME4Q14997 1843 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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CHTF18-213ENST00000498439 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.25■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 SLC10A3P09131 477 aa23.24■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 RGS19P49795 217 aa23.24■■□□□ 1.31
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CHTF18-213ENST00000498439 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.24■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 FLIIQ13045 1269 aa23.23■■□□□ 1.31
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CHTF18-213ENST00000498439 DLK2Q6UY11 383 aa23.23■■□□□ 1.31
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CHTF18-213ENST00000498439 COL4A1P02462 1669 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 ITGA6P23229 1130 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 KCNJ4P48050 445 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 GCKRQ14397 625 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 LINS1Q8NG48 757 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 TRPA1O75762 1119 aa23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 WDR63Q8IWG1 891 aa23.21■■□□□ 1.31
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CHTF18-213ENST00000498439 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-213ENST00000498439 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.2■■□□□ 1.3
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CHTF18-213ENST00000498439 RNF186Q9NXI6 227 aa23.2■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 CSF1RP07333 972 aa23.19■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 DACT2Q5SW24 774 aa23.19■■□□□ 1.3
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CHTF18-213ENST00000498439 G2E3Q7L622 706 aa23.18■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 MRS2Q9HD23 443 aa23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 WNT10BO00744 389 aa23.16■■□□□ 1.3
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CHTF18-213ENST00000498439 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.16■■□□□ 1.3
CHTF18-213ENST00000498439 VAMP4O75379 141 aa23.14■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 CHRNDQ07001 517 aa23.14■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 SPEF2Q9C093 1822 aa23.14■■□□□ 1.29
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CHTF18-213ENST00000498439 MYO1BO43795 1136 aa23.12■■□□□ 1.29
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CHTF18-213ENST00000498439 SREBF2Q12772 1141 aa23.12■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 CCDC184Q52MB2 194 aa23.12■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.12■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 CD209Q9NNX6 404 aa23.12■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.12■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 DLGAP5Q15398 846 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 TM4SF4P48230 202 aa23.1■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 INHBEP58166 350 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 MXD3Q9BW11 206 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 UNCXA6NJT0 531 aa23.08■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CHTF18-213ENST00000498439 ALDH1A1P00352 501 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 BEND3Q5T5X7 828 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 SASH1O94885 1247 aa23.06■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.06■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.06■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 TAF5LO75529 589 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 ALDH1L1O75891 902 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 IL1R1P14778 569 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 FOXO4P98177 505 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 MOB2Q70IA6 237 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-213ENST00000498439 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.05■■□□□ 1.28
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