RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 GREM2Q9H772 168 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 PSME4Q14997 1843 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 CACNA1FO60840 1977 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 GCKRQ14397 625 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 DLK2Q6UY11 383 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 LINS1Q8NG48 757 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZIC5Q96T25 663 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYH3P11055 1940 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CSF1RP07333 972 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 FLIIQ13045 1269 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 DGKZQ13574 1117 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 DACT2Q5SW24 774 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 WDR63Q8IWG1 891 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 RNF186Q9NXI6 227 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ITGA6P23229 1130 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 NF2P35240 595 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CSRNP1Q96S65 589 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRPA1O75762 1119 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM161AQ3B820 660 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 G2E3Q7L622 706 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 WNT10BO00744 389 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CASP7P55210 303 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 KCNJ4P48050 445 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 VAMP4O75379 141 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHRNDQ07001 517 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC184Q52MB2 194 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 MRS2Q9HD23 443 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 UNCXA6NJT0 531 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TM4SF4P48230 202 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXW7Q969H0 707 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CD209Q9NNX6 404 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANP32CO43423 234 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SREBF2Q12772 1141 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 GTF2IP78347 998 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 INHBEP58166 350 aa21.38■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-207ENST00000497251 BEND3Q5T5X7 828 aa21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.38■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-207ENST00000497251 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.38■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALDH1L1O75891 902 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALDH1A1P00352 501 aa21.36■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-207ENST00000497251 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRM8O00222 908 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 SASH1O94885 1247 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP3K11Q16584 847 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPEF2Q9C093 1822 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 KLRK1P26718 216 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC3-207ENST00000497251 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.34■■□□□ 1.01
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