RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 ITGB2P05107 769 aa8.75□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 KCNA1Q09470 495 aa8.75□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP4P98171 946 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 ADGRE1Q14246 886 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 ILDR2Q71H61 639 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 CHRDQ9H2X0 955 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 EREGO14944 169 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 SELPP16109 830 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 OSMRQ99650 979 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 ARL4DP49703 201 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 MBTPS1Q14703 1052 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 WNT8BQ93098 351 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-241ENST00000496183 LINC01387J3KSC0 135 aa8.71□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.71□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.71□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ADAM19Q9H013 955 aa8.71□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 H3BRJ5 948 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 DLL1O00548 723 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 SETDB1Q15047 1291 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 FAM129BQ96TA1 746 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 PIP4K2BP78356 416 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 BSNDQ8WZ55 320 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 FSCN2O14926 492 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 DOC2BQ14184 412 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ECM1Q16610 540 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 EPHA1P21709 976 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 CDC25BP30305 580 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 NXPE3Q969Y0 559 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 FURINP09958 794 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 MAPK1P28482 360 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 NFKBIEO00221 500 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ACPPP15309 386 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 IKBKEQ14164 716 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 CEP41Q9BYV8 373 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 SOX13Q9UN79 622 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-241ENST00000496183 ADAM23O75077 832 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 TP53INP1Q96A56 240 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 TRPA1O75762 1119 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 ORC1Q13415 861 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 ACAD11Q709F0 780 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 EHD4Q9H223 541 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 F8W735 103 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 GPR182O15218 404 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 GLB1P16278 677 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 NOS3P29474 1203 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 HHIPQ96QV1 700 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 CSRNP1Q96S65 589 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms