RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492959.1

GTF2E1-204, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

TSL 4

Gene GTF2E1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-204ENST00000492959 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 SLC10A3P09131 477 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 MYH3P11055 1940 aa14.58□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.58□□□□□ -0.07
GTF2E1-204ENST00000492959 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 GMLQ99445 158 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 MED23Q9ULK4 1368 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 IGKV5-2P06315 115 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 OGFOD1Q8N543 542 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 TSPYL6Q8N831 410 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 RNF186Q9NXI6 227 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 TRPA1O75762 1119 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 MMP14P50281 582 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 CSRNP1Q96S65 589 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 GREM2Q9H772 168 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 CCDC27Q2M243 656 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 COA1Q9GZY4 146 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 SPEF2Q9C093 1822 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 DACT2Q5SW24 774 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 H7C1W4 665 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 NF2P35240 595 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 FBXW7Q969H0 707 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 IL16Q14005 1332 aa14.52□□□□□ -0.08
GTF2E1-204ENST00000492959 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 WWC1Q8IX03 1113 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 WNT10BO00744 389 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 ITGA6P23229 1130 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 GCKRQ14397 625 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 SLC34A2O95436 690 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 KCNJ4P48050 445 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 FLIIQ13045 1269 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 G2E3Q7L622 706 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 LINS1Q8NG48 757 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 MXD3Q9BW11 206 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 CACNA1FO60840 1977 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 MOB2Q70IA6 237 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 SASH1O94885 1247 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 CSF1RP07333 972 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 TM4SF4P48230 202 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 CASP7P55210 303 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 GTF2IP78347 998 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 CHRNDQ07001 517 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 SREBF2Q12772 1141 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 KLRK1P26718 216 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 SOX10P56693 466 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 CD209Q9NNX6 404 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF2E1-204ENST00000492959 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.46□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.45□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 TBC1D8O95759 1140 aa14.45□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 DLGAP5Q15398 846 aa14.45□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 MYO1BO43795 1136 aa14.44□□□□□ -0.1
GTF2E1-204ENST00000492959 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms