RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC102AQ96A19 550 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-210ENST00000489601 MRS2Q9HD23 443 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-210ENST00000489601 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-210ENST00000489601 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-210ENST00000489601 VAMP4O75379 141 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 CSF1RP07333 972 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 CASP7P55210 303 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 CDCA5Q96FF9 252 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 LINS1Q8NG48 757 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 COA1Q9GZY4 146 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ITGA6P23229 1130 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ANP32CO43423 234 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 DACT2Q5SW24 774 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 MMP14P50281 582 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 FKBP1BP68106 108 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM161AQ3B820 660 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC10A3P09131 477 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 OGFOD1Q8N543 542 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-210ENST00000489601 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 MXD3Q9BW11 206 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 WNT10BO00744 389 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 CHRNDQ07001 517 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXW7Q969H0 707 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 KLRK1P26718 216 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 BEND3Q5T5X7 828 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 CSRNP1Q96S65 589 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF186Q9NXI6 227 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1B0GUL6 1792 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 F6X3S4 739 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 FOXO4P98177 505 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNJ4P48050 445 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 RGS19P49795 217 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 DGKZQ13574 1117 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 CD209Q9NNX6 404 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 TRPA1O75762 1119 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 GTF2IP78347 998 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-210ENST00000489601 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 MOB2Q70IA6 237 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 GRM8O00222 908 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 TAF5LO75529 589 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 SASH1O94885 1247 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 NF2P35240 595 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 SNAP23O00161 211 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 ALDH1L1O75891 902 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 IL1R1P14778 569 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-210ENST00000489601 DLGAP5Q15398 846 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-210ENST00000489601 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-210ENST00000489601 CERS5Q8N5B7 392 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms