RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488865.2

RNF220-216, Transcript of ring finger protein 220, human

TSL 2

Gene RNF220, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF220-216	ENST00000488865	LINS1	Q8NG48	757 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	CSF1R	P07333	972 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	SCARF1	Q14162	830 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	ITGA6	P23229	1130 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	RGMB	Q6NW40	437 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	COA1	Q9GZY4	146 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RNF220-216	ENST00000488865	FAM161A	Q3B820	660 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	CCDC102A	Q96A19	550 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	TSKS	Q9UJT2	592 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	CDCA5	Q96FF9	252 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	ABHD8	Q96I13	439 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	ZIC5	Q96T25	663 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	MMP14	P50281	582 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.89
RNF220-216	ENST00000488865	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	OGFOD1	Q8N543	542 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	FKBP1B	P68106	108 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	BEND3	Q5T5X7	828 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865		F6X3S4	739 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	CHRND	Q07001	517 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	MXD3	Q9BW11	206 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	FOXO4	P98177	505 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	FBXW7	Q969H0	707 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	SLC10A3	P09131	477 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	KCNJ4	P48050	445 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	KLRK1	P26718	216 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
RNF220-216	ENST00000488865	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	WNT10B	O00744	389 aa		33	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		33	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	GRM8	O00222	908 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	GTF2I	P78347	998 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	TAF5L	O75529	589 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RNF220-216	ENST00000488865	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	SNAP23	O00161	211 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	SASH1	O94885	1247 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	NF2	P35240	595 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	TRPA1	O75762	1119 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	IL1R1	P14778	569 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	DGKZ	Q13574	1117 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	MOB2	Q70IA6	237 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
RNF220-216	ENST00000488865	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RNF220-216	ENST00000488865	CERS5	Q8N5B7	392 aa		32.87	■■■□□ 2.85

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