RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487774.1

C7orf49-211, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C7orf49, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-211ENST00000487774 HOXB7P09629 217 aa24.74■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.74■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 HYPKQ9NX55 129 aa24.74■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 IFNL1Q8IU54 200 aa24.73■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 MED23Q9ULK4 1368 aa24.72■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.72■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 OGFOD1Q8N543 542 aa24.72■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 FZD1Q9UP38 647 aa24.72■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 PDE8AO60658 829 aa24.71■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 LAMB1P07942 1786 aa24.7■■□□□ 1.55
C7orf49-211ENST00000487774 CEP290O15078 2479 aa24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.7■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.69■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.69■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 ARMC5Q96C12 935 aa24.69■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 MYD88Q99836 296 aa24.69■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.69■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 INHBEP58166 350 aa24.68■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 NEUROD2Q15784 382 aa24.68■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 FBXW7Q969H0 707 aa24.68■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 GOLGA2Q08379 1002 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 SZT2Q5T011 3432 aa24.67■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CAP1Q01518 475 aa24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 MAP3K11Q16584 847 aa24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 ERO1AQ96HE7 468 aa24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 WNK4Q96J92 1243 aa24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 SPEF2Q9C093 1822 aa24.65■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 COA1Q9GZY4 146 aa24.65■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 MMP14P50281 582 aa24.64■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.64■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C7orf49-211ENST00000487774 CRHR2Q13324 411 aa24.63■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.63■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.63■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 CTSWP56202 376 aa24.62■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 EFCC1Q9HA90 598 aa24.62■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.61■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 KLRK1P26718 216 aa24.6■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 GJA5P36382 358 aa24.6■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.6■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 GREM2Q9H772 168 aa24.6■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF333Q96JL9 665 aa24.59■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 PTPN18Q99952 460 aa24.59■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 MBIPQ9NS73 344 aa24.59■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 SP3Q02447 781 aa24.58■■□□□ 1.53
C7orf49-211ENST00000487774 MYH3P11055 1940 aa24.57■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 GTF2IP78347 998 aa24.57■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.57■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.57■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 UNCXA6NJT0 531 aa24.56■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.56■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.56■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.56■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 DLGAP5Q15398 846 aa24.55■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.55■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 CERS5Q8N5B7 392 aa24.55■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.55■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.55■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 H0YGN5 161 aa24.54■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 RUNDC1Q96C34 613 aa24.54■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 OTUD5Q96G74 571 aa24.54■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 IGKV5-2P06315 115 aa24.53■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF853P0CG23 659 aa24.53■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.53■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 AOX1Q06278 1338 aa24.53■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
C7orf49-211ENST00000487774 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms