RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 MYRFLQ96LU7 910 aa6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 WDR64B1ANS9 1081 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 ADAM11O75078 769 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 WNT11O96014 354 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 NLRP12P59046 1061 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 UVSSAQ2YD98 709 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 BEND4Q6ZU67 534 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.76□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 PRR19A6NJB7 356 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 PREPP48147 710 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.75□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.75□□□□□ -1.33
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SENP6-210ENST00000487548 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 ZAP70P43403 619 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 DTX1Q86Y01 620 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FBXL6Q8N531 539 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 COL26A1Q96A83 441 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.74□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 TNFRSF10BO14763 440 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FDX2Q6P4F2 183 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 PBX4Q9BYU1 374 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 TM4SF5O14894 197 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 ACPPP15309 386 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 RXRBP28702 533 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SENP6-210ENST00000487548 TRPA1O75762 1119 aa6.71□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 CABP4P57796 275 aa6.71□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ABI1Q8IZP0 508 aa6.71□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 H3BRJ5 948 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ZBTB39O15060 712 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 FZD5Q13467 585 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 OCLNQ16625 522 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 STK32AQ8WU08 396 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ZMYND15Q9H091 742 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 RNF208Q9H0X6 261 aa6.7□□□□□ -1.34
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SENP6-210ENST00000487548 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 SGO2Q562F6 1265 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 HGSNATQ68CP4 663 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 CEP120Q8N960 986 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ELP3Q9H9T3 547 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ATG3Q9NT62 314 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 PIM2Q9P1W9 311 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.69□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 KIF4AO95239 1232 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 PIP4K2BP78356 416 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ATCAYQ86WG3 371 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 HHIPQ96QV1 700 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 USP26Q9BXU7 913 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.67□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 CNTN3Q9P232 1028 aa6.67□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 STIM2Q9P246 746 aa6.67□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.66□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 ADAM19Q9H013 955 aa6.66□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 F13BP05160 661 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 CES1P23141 567 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 NFKBIBQ15653 356 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 SHISA5Q8N114 240 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.65□□□□□ -1.34
SENP6-210ENST00000487548 A6NHS1 94 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP6-210ENST00000487548 ARL4DP49703 201 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP6-210ENST00000487548 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.64□□□□□ -1.35
SENP6-210ENST00000487548 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.64□□□□□ -1.35
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