RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485692.1

GTF3C5-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-209ENST00000485692 USP17L8P0C7I0 530 aa26.6■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 LBX1P52954 281 aa26.6■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SULF1Q8IWU6 871 aa26.6■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 COA1Q9GZY4 146 aa26.6■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GGA3Q9NZ52 723 aa26.6■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ADM5C9JUS6 153 aa26.59■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.59■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF521Q96K83 1311 aa26.59■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CAPN15O75808 1086 aa26.58■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.58■■□□□ 1.85
GTF3C5-209ENST00000485692 AOC2O75106 756 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 HUNKP57058 714 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 FOXO4P98177 505 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 DLK2Q6UY11 383 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.57■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 KCNJ4P48050 445 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 CHRNDQ07001 517 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 SCARF1Q14162 830 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 DACT2Q5SW24 774 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 GRM8O00222 908 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.55■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 ALDH1L1O75891 902 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 OGFOD1Q8N543 542 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 FBXW7Q969H0 707 aa26.54■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 CA12O43570 354 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 MMP14P50281 582 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 NOGQ13253 232 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.53■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 KLRK1P26718 216 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 CDCA5Q96FF9 252 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C5-209ENST00000485692 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 RGMBQ6NW40 437 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 MXD3Q9BW11 206 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 E9PSI1 815 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 CCDC102AQ96A19 550 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 TAF5LO75529 589 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 CD209Q9NNX6 404 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 A0A1B0GUL6 1792 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 FKBP1BP68106 108 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 GTF2IP78347 998 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C5-209ENST00000485692 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 WNT10BO00744 389 aa26.45■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.45■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.45■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 PTPRCP08575 1304 aa26.44■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SNAP23O00161 211 aa26.44■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.44■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 TSKSQ9UJT2 592 aa26.44■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 UTYO14607 1347 aa26.43■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 ZIC5Q96T25 663 aa26.43■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.43■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SLFN5Q08AF3 891 aa26.42■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SUCLG2Q96I99 432 aa26.42■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SASH1O94885 1247 aa26.41■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC10A3P09131 477 aa26.41■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 IL1R1P14778 569 aa26.41■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 KAZALD1Q96I82 304 aa26.41■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 PLIN1O60240 522 aa26.4■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.39■■□□□ 1.82
GTF3C5-209ENST00000485692 NF2P35240 595 aa26.38■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 UBE4AQ14139 1066 aa26.37■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 CERS5Q8N5B7 392 aa26.37■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.37■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 DLGAP5Q15398 846 aa26.36■■□□□ 1.81
GTF3C5-209ENST00000485692 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms