RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 CEP135Q66GS9 1140 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 A6NHS1 94 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 FAM13AO94988 1023 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ILDR2Q71H61 639 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 POLIQ9UNA4 740 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 FAM177BA6PVY3 158 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 KIF4AO95239 1232 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 CES1P23141 567 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 CNTN3Q9P232 1028 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC8Q09428 1581 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 XKR5Q6UX68 686 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 MUC3BQ9H195 1237 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PPME1Q9Y570 386 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 NPR3P17342 541 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CDC27P30260 824 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 RETREG2Q8NC44 543 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 TP53INP1Q96A56 240 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PBX4Q9BYU1 374 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC6Q03468 1493 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM2Q13029 1718 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 H3BRB1 525 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01387J3KSC0 135 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CDC25BP30305 580 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 USP5P45974 858 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 EHHADHQ08426 723 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CEP120Q8N960 986 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 DLL1O00548 723 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 FZD6O60353 706 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PHACTR2O75167 634 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRAP18433 802 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 SERPINB4P48594 390 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 SETDB1Q15047 1291 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PMEPA1Q969W9 287 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CHRDQ9H2X0 955 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 ACPPP15309 386 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 NOS3P29474 1203 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF21O75509 655 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 EPHA1P21709 976 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 PDE4CQ08493 712 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-211ENST00000484135 EREGO14944 169 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ICMTO60725 284 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 CABP4P57796 275 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 GJD3Q8N144 294 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 PAX4O43316 350 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 TRPA1O75762 1119 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 ALX3O95076 343 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 MCTP1Q6DN14 999 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-211ENST00000484135 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.82□□□□□ -1.16
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