RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 RARAP10276 462 aa6.86□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 C8orf34Q49A92 452 aa6.86□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 Q6ZS46 218 aa6.86□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.86□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.86□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 NRLP54845 237 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 NLRP13Q86W25 1043 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 CITED4Q96RK1 184 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.85□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 EHHADHQ08426 723 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 PDE3BQ13370 1112 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC27Q2M243 656 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 MCTP1Q6DN14 999 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 TMC1Q8TDI8 760 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 FAM129BQ96TA1 746 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 ELP3Q9H9T3 547 aa6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
MFSD1-211ENST00000476860 GPR182O15218 404 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 MMP20O60882 483 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 SOX18P35713 384 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 CD97P48960 835 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 XKR5Q6UX68 686 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 TMC7Q7Z402 723 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.83□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 ASB16Q96NS5 453 aa6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.82□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 F8W735 103 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 TNFRSF21O75509 655 aa6.81□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 IGHA2P01877 340 aa6.81□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 FSTP19883 344 aa6.81□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 OR13H1Q8NG92 308 aa6.81□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.8□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 BTBD11A6QL63 1104 aa6.8□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 PHACTR2O75167 634 aa6.8□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 PSAPP07602 524 aa6.8□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 TREHO43280 583 aa6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 SETDB1Q15047 1291 aa6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 PLD4Q96BZ4 506 aa6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 CHRDQ9H2X0 955 aa6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 CNTN3Q9P232 1028 aa6.79□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 ORC1Q13415 861 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.78□□□□□ -1.32
MFSD1-211ENST00000476860 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 TM4SF5O14894 197 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 ALX3O95076 343 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 KIF4AO95239 1232 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 NEFLP07196 543 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 CES1P23141 567 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 SIK1P57059 783 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 DSC3Q14574 896 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.77□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 EREGO14944 169 aa6.76□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 HYAL2Q12891 473 aa6.76□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.76□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 J3QW42 95 aa6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 GSC2O15499 205 aa6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.75□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 SSTR4P31391 388 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 PLCB3Q01970 1234 aa6.74□□□□□ -1.33
MFSD1-211ENST00000476860 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.74□□□□□ -1.33
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