RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476111.5

USP22-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-204ENST00000476111 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.46■■□□□ 1.35
USP22-204ENST00000476111 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.46■■□□□ 1.35
USP22-204ENST00000476111 COA1Q9GZY4 146 aa23.46■■□□□ 1.35
USP22-204ENST00000476111 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP22-204ENST00000476111 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.45■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.45■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.45■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 USP48Q86UV5 1035 aa23.45■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.45■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.45■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 CAPNS2Q96L46 248 aa23.44■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.44■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 SNAP23O00161 211 aa23.43■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.43■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 PTPRCP08575 1304 aa23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 SUCLG2Q96I99 432 aa23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 MXD3Q9BW11 206 aa23.42■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 G3V3G9 751 aa23.41■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 USP17L8P0C7I0 530 aa23.41■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.41■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 ADM5C9JUS6 153 aa23.4■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.4■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.4■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 GGA3Q9NZ52 723 aa23.4■■□□□ 1.34
USP22-204ENST00000476111 TAF5LO75529 589 aa23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ECE1P42892 770 aa23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CD209Q9NNX6 404 aa23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.38■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 SCARF1Q14162 830 aa23.38■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.37■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 MAP2K2P36507 400 aa23.37■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 USP44Q9H0E7 712 aa23.37■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 IL1R1P14778 569 aa23.36■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 MMP14P50281 582 aa23.36■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.36■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.36■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 AOC2O75106 756 aa23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CERS5Q8N5B7 392 aa23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 WNT10BO00744 389 aa23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.34■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 CDCA5Q96FF9 252 aa23.33■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 ZIC5Q96T25 663 aa23.33■■□□□ 1.33
USP22-204ENST00000476111 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.32■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 HUNKP57058 714 aa23.32■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 GTF2IP78347 998 aa23.32■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 SULF1Q8IWU6 871 aa23.32■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 TNS4Q8IZW8 715 aa23.32■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 UBE4AQ14139 1066 aa23.31■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.31■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 AIDAQ96BJ3 306 aa23.31■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.3■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 KCNJ4P48050 445 aa23.3■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 LBX1P52954 281 aa23.3■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.3■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.3■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.3■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 LRRC24Q50LG9 513 aa23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 RGMBQ6NW40 437 aa23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 OGFOD1Q8N543 542 aa23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.28■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 NOGQ13253 232 aa23.27■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.27■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.27■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP22-204ENST00000476111 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms