RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 USP17L4A6NCW7 530 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 EYA2O00167 538 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 TAF5LO75529 589 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 CIAO1O76071 339 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 EPS15P42566 896 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 TNNQ9UQP3 1299 aa23.62■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 METTL24Q5JXM2 366 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 COPRSQ9NQ92 184 aa23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 PDE8BO95263 885 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 APLP1P51693 650 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 LRRC24Q50LG9 513 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 SCN9AQ15858 1988 aa23.6■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 CD209Q9NNX6 404 aa23.59■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 PLIN1O60240 522 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 IL1R1P14778 569 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 MICALL2Q8IY33 904 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SYF2-203ENST00000474160 SRGAP3O43295 1099 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 KLRK1P26718 216 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 POTEIP0CG38 1075 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 POTEJP0CG39 1038 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 RLBP1P12271 317 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 DACT2Q5SW24 774 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 GMLQ99445 158 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 SNAP23O00161 211 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 PDE3AQ14432 1141 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 USP17L8P0C7I0 530 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 FGFR2P21802 821 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 CNTROBQ8N137 903 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 LPIN2Q92539 896 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 SASH1O94885 1247 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 SLC5A1P13866 664 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 VPS37DQ86XT2 251 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 OGFOD1Q8N543 542 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 PASKQ96RG2 1323 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB22O15209 634 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 GTF2IP78347 998 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 PANK1Q8TE04 598 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 ATP8B2P98198 1209 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 SIL1Q9H173 461 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 POLA2Q14181 598 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 SSH3Q8TE77 659 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 FBXW7Q969H0 707 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 GYG1P46976 350 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 ATP2B3Q16720 1220 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 CREBZFQ9NS37 354 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 SHTN1A0MZ66 631 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms