RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP2B3Q16720 1220 aa26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 LPIN2Q92539 896 aa26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-212ENST00000472427 COL4A5P29400 1685 aa26.89■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.88■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 VPS37DQ86XT2 251 aa26.88■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 TNIP1Q15025 636 aa26.87■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 PODNQ7Z5L7 613 aa26.87■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 GLTPD2A6NH11 291 aa26.86■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 SNAP23O00161 211 aa26.86■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 TFCP2Q12800 502 aa26.86■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 GPC2Q8N158 579 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 FGFR2P21802 821 aa26.84■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 KLRK1P26718 216 aa26.84■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.84■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 RAB11FIP3O75154 756 aa26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-212ENST00000472427 RAD17O75943 681 aa26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR108Q9NPR9 543 aa26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 SASH1O94885 1247 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 GYG1P46976 350 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 CXCL9Q07325 125 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXW7Q969H0 707 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 CD209Q9NNX6 404 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF609O15014 1411 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A1B0GUL7 405 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 YDJCA8MPS7 323 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 NEFLP07196 543 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 GORABQ5T7V8 394 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 USP17L3A6NCW0 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 USP17L4A6NCW7 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 APBB1O00213 710 aa26.78■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 IL1R1P14778 569 aa26.78■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.77■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 TNNI3KQ59H18 835 aa26.77■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.77■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.77■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR90Q96KV7 1748 aa26.76■■□□□ 1.88
RALGPS1-212ENST00000472427 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMD14O00487 310 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 TIMM10P62072 90 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 PSME4Q14997 1843 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 BCAMP50895 628 aa26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 XAGE2Q96GT9 111 aa26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 DCTPP1Q9H773 170 aa26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 GTF2IP78347 998 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 HACL1Q9UJ83 578 aa26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 SCN9AQ15858 1988 aa26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 SEMA3EO15041 775 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 ADORA1P30542 326 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 AACSQ86V21 672 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 SCN4AP35499 1836 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC102BQ68D86 513 aa26.71■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 GCC1Q96CN9 775 aa26.71■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 RRAGCQ9HB90 399 aa26.71■■□□□ 1.87
RALGPS1-212ENST00000472427 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
RALGPS1-212ENST00000472427 DACT2Q5SW24 774 aa26.7■■□□□ 1.86
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms