RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472365.6

DMKN-238, Transcript of dermokine, human

TSL 2

Gene DMKN, Length 606 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-238	ENST00000472365	CSF1R	P07333	972 aa		15.28	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	ITGA6	P23229	1130 aa		15.28	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	GGA3	Q9NZ52	723 aa		15.28	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	AOC2	O75106	756 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	EGFR	P00533	1210 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	FKBP1B	P68106	108 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	SCARF1	Q14162	830 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	RGMB	Q6NW40	437 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	GML	Q99445	158 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		15.27	■□□□□ 0.04
DMKN-238	ENST00000472365	SCN9A	Q15858	1988 aa		15.26	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	KCNJ4	P48050	445 aa		15.26	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		15.25	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	PSME4	Q14997	1843 aa		15.25	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	CASP7	P55210	303 aa		15.25	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		15.25	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	ADM5	C9JUS6	153 aa		15.24	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	FAM161A	Q3B820	660 aa		15.24	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	DACT2	Q5SW24	774 aa		15.23	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	BEND3	Q5T5X7	828 aa		15.23	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		15.23	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		15.23	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	CDCA5	Q96FF9	252 aa		15.23	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		15.23	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	ALDH1L1	O75891	902 aa		15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	NF2	P35240	595 aa		15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	CHRND	Q07001	517 aa		15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	FBXW7	Q969H0	707 aa		15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	ABHD8	Q96I13	439 aa		15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	GRM8	O00222	908 aa		15.21	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		15.21	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		15.21	■□□□□ 0.03
DMKN-238	ENST00000472365	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	SLC10A3	P09131	477 aa		15.2	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	FOXO4	P98177	505 aa		15.2	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		15.2	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		15.2	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365		F6X3S4	739 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	WNT10B	O00744	389 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	DLK2	Q6UY11	383 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	CD209	Q9NNX6	404 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	SPEF2	Q9C093	1822 aa		15.19	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	GTF2I	P78347	998 aa		15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15.18	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		15.17	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	MYO1B	O43795	1136 aa		15.17	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		15.17	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		15.17	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365		E9PSI1	815 aa		15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	IL1R1	P14778	569 aa		15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	DLGAP5	Q15398	846 aa		15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	PTPRC	P08575	1304 aa		15.16	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	TAF5L	O75529	589 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	UBE4A	Q14139	1066 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	CSRNP1	Q96S65	589 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	ZIC5	Q96T25	663 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	MXD3	Q9BW11	206 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	RNF186	Q9NXI6	227 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	ZNF521	Q96K83	1311 aa		15.15	■□□□□ 0.02
DMKN-238	ENST00000472365	SASH1	O94885	1247 aa		15.14	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	KLRK1	P26718	216 aa		15.14	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	UNCX	A6NJT0	531 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	TRPA1	O75762	1119 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	DGKZ	Q13574	1117 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	UTY	O14607	1347 aa		15.13	■□□□□ 0.01
DMKN-238	ENST00000472365	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		15.13	■□□□□ 0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms