RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MCM5	P33992	734 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGS19	P49795	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SCNN1D	P51172	638 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NOG	Q13253	232 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IER5L	Q5T953	404 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MPND	Q8N594	471 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYL6B	P14649	208 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EPS15	P42566	896 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NFE2L2	Q16236	605 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC34A2	O95436	690 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPT	P24298	496 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GRM1	Q13255	1194 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NTSR2	O95665	410 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DPF2	Q92785	391 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EYA3	Q99504	573 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUP98	P52948	1817 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CXCL9	Q07325	125 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AOC3	Q16853	763 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CST9	Q5W186	159 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GRAP	Q13588	217 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.03	□□□□□ -0.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676		G3V3G9	751 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	APAF1	O14727	1248 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OFD1	O75665	1012 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGHD	P01880	384 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC4	O15439	1325 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.02	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HUNK	P57058	714 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRAF5	O00463	557 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HOXB7	P09629	217 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MMP14	P50281	582 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUCB2	P80303	420 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DGKZ	Q13574	1117 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGMB	Q6NW40	437 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC39A7	Q92504	469 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.99	□□□□□ -0.65

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