RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466195.1

TSPAN13-202, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN13, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-202ENST00000466195 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.98■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.98■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.98■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 KIF16BQ96L93 1317 aa15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 SHTN1A0MZ66 631 aa15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 TAF5LO75529 589 aa15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 ZNF609O15014 1411 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 PLIN1O60240 522 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 USP17L8P0C7I0 530 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 CNTNAP1P78357 1384 aa15.96■□□□□ 0.15
TSPAN13-202ENST00000466195 A0A1B0GUL6 1792 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 TRAF5O00463 557 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 OGFOD1Q8N543 542 aa15.95■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 KAZALD1Q96I82 304 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 USP44Q9H0E7 712 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 RASSF10A6NK89 507 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 KLRK1P26718 216 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 MMP14P50281 582 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 USP48Q86UV5 1035 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 CD209Q9NNX6 404 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 EGFRP00533 1210 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 GTF2IP78347 998 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 UBE4AQ14139 1066 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 DACT2Q5SW24 774 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 SULF1Q8IWU6 871 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 GGA3Q9NZ52 723 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 SNAP23O00161 211 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 ECE1P42892 770 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 VEGFBP49765 207 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 SCARF1Q14162 830 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 METTL24Q5JXM2 366 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 GMLQ99445 158 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 GRM1Q13255 1194 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 CST9Q5W186 159 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 VPS37DQ86XT2 251 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN13-202ENST00000466195 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 IL1R1P14778 569 aa15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 AIDAQ96BJ3 306 aa15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 MXD3Q9BW11 206 aa15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 ADM5C9JUS6 153 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 GNAI3P08754 354 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 LRRC24Q50LG9 513 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 CAPNS2Q96L46 248 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13-202ENST00000466195 BCAR3O75815 825 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms