RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.29	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GUL7	405 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	KLRK1	P26718	216 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	BCAM	P50895	628 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	PRELP	P51888	382 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	AACS	Q86V21	672 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	COA1	Q9GZY4	146 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	COL4A1	P02462	1669 aa		10.28	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	CACNA1S	Q13698	1873 aa		10.27	□□□□□ -0.76
IL6-208	ENST00000464710	ECE2	O60344	883 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	FGFR2	P21802	821 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CD209	Q9NNX6	404 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.27	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	RAD17	O75943	681 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ADORA1	P30542	326 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.26	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	GTF2I	P78347	998 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	TNIP1	Q15025	636 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.25	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	FZD9	O00144	591 aa		10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	PHKA1	P46020	1223 aa		10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CXCL9	Q07325	125 aa		10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.24	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	PSMD14	O00487	310 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	IL1R1	P14778	569 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.23	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	YY1	P25490	414 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	SNED1	Q8TER0	1413 aa		10.22	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	NUCB1	Q02818	461 aa		10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.21	□□□□□ -0.77
IL6-208	ENST00000464710	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.21	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SEMA3E	O15041	775 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78

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