RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 BCL11AQ9H165 835 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GUL7 405 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 FOXP2O15409 715 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NTSR2O95665 410 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CHGBP05060 677 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 FGFR2P21802 821 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 PKP1Q13835 747 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 RUFY3Q7L099 469 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 GREM2Q9H772 168 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 TAF1P21675 1872 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 FSD2A1L4K1 749 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SLC27A2O14975 620 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 PDE8AO60658 829 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 BRD1O95696 1058 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 GPTP24298 496 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ADORA1P30542 326 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 TIMM10P62072 90 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 VPS53Q5VIR6 699 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SUSD4Q5VX71 490 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 TCHHQ07283 1943 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 LARGE1O95461 756 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ITGA6P23229 1130 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1AP38606 617 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 AK2P54819 239 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NUCB2P80303 420 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SCARF1Q14162 830 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 PARP10Q53GL7 1025 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CHD4Q14839 1912 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 MAST3O60307 1309 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA1SQ13698 1873 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP2B3Q16720 1220 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.79□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 RPS6KB1P23443 525 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL16Q8N461 479 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 NGLY1Q96IV0 654 aa6.78□□□□□ -1.32
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