RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0G2JLW4 131 aa29.98■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 SIK1P57059 783 aa29.98■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 GTF3C6Q969F1 213 aa29.98■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABCC12Q96J65 1359 aa29.98■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 FGD1P98174 961 aa29.97■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.97■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 BRF1Q92994 677 aa29.97■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLIT2O94813 1529 aa29.97■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUSD4Q5VX71 490 aa29.96■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 LAMA4Q16363 1823 aa29.96■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 E7EWF7 191 aa29.95■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDE8BO95263 885 aa29.95■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.95■■■□□ 2.39
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCAMP43121 646 aa29.95■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBE2HP62256 183 aa29.95■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIP4K2BP78356 416 aa29.95■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITPK1Q13572 414 aa29.95■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM177BA6PVY3 158 aa29.94■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.94■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC173Q0VFZ6 552 aa29.94■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 BARGINQ6ZT62 677 aa29.94■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.93■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.93■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 APPBP2Q92624 585 aa29.93■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 AK7Q96M32 723 aa29.93■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 FERMT3Q86UX7 667 aa29.92■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 JAK2O60674 1132 aa29.92■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHF14O94880 888 aa29.91■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAMTA2O94983 1202 aa29.91■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 FOXP2O15409 715 aa29.9■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCRN1Q12765 414 aa29.9■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R9BQ96SB3 815 aa29.9■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.9■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.9■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.89■■■□□ 2.38
PLEKHF1-201ENST00000436066 APOBRQ0VD83 1088 aa29.89■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNQ2O43526 872 aa29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 PFKFB2O60825 505 aa29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC102BQ68D86 513 aa29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRP5O75197 1615 aa29.88■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 PARP10Q53GL7 1025 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 RREB1Q92766 1687 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHKA1P46020 1223 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT85P78386 507 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC183Q5T5S1 534 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHST3Q7LGC8 479 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 LPIN2Q92539 896 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSPY26PQ9H489 355 aa29.87■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYH7P12883 1935 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPAA1O43292 621 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 FGAP02671 866 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM173BQ6P4H8 233 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 TOM1O60784 492 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 HAND2P61296 217 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX11Q96FC9 970 aa29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADD2P35612 726 aa29.85■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.85■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
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PLEKHF1-201ENST00000436066 FGFR2P21802 821 aa29.84■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
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PLEKHF1-201ENST00000436066 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.84■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.84■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.83■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 IDH1O75874 414 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF214Q8ND24 703 aa29.83■■■□□ 2.37
PLEKHF1-201ENST00000436066 NTSR2O95665 410 aa29.82■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC6Q86TZ1 520 aa29.82■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCT2P78371 535 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.81■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 H3BQV1 296 aa29.81■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC5A1P13866 664 aa29.81■■■□□ 2.36
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFFO2Q5TF58 517 aa29.81■■■□□ 2.36
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