RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZIC5Q96T25 663 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM13AO94988 1023 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFT43Q96FT9 208 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUSD3Q96L08 255 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM47Q96LD4 638 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 SENP2Q9HC62 589 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPAMQ9HCL2 828 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA3Q99758 1704 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35F4A4IF30 521 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNA6P17658 529 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTSQ03393 145 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ILDR2Q71H61 639 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATCAYQ86WG3 371 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIFC2Q96AC6 838 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUBCNLQ9H714 662 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 METP08581 1390 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PNR3 127 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 F11P03951 625 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 TREML1Q86YW5 311 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABTB2Q8N961 1025 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS22Q8NE09 1264 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTCH1Q13635 1447 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 FZD6O60353 706 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 THBS1P07996 1170 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZAP70P43403 619 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIF1AQ16665 826 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP6O75581 1613 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITSN1Q15811 1721 aa6.53□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF1AQ12756 1690 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 MST1RQ04912 1400 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 MICAL2O94851 1124 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK1P28482 360 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 AAMPQ13685 434 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 IER5Q5VY09 327 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3R4Q99570 1358 aa6.52□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3C2GO75747 1445 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCCP43146 1447 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPLAHO14841 1288 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 IDH3AP50213 366 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGBD3Q8N328 593 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLIQ9UNA4 740 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYOM2P54296 1465 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.51□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP32Q8NFA0 1604 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 INPP5BP32019 993 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 DBN1Q16643 649 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRP8Q86W28 1048 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR152Q8TDT2 470 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDEM1Q92611 657 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.5□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRB2O60241 1585 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 TYRO3Q06418 890 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGL3Q3MIN7 710 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFHC2Q5JST6 749 aa6.49□□□□□ -1.37
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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