RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435328.1

RAPGEF4-AS1-202, RAPGEF4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF4-AS1, Length 4,625 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.99□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GRM8O00222 908 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IL13P35225 146 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VPS36Q86VN1 386 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 APOBRQ0VD83 1088 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.98□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 A0A1B0GUA9 196 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KIF5AQ12840 1032 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ME3Q16798 604 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TSG101Q99816 390 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 STAP2Q9UGK3 403 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FANCAO15360 1455 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 AKR1B10O60218 316 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PPFIA3O75145 1194 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 VAV2P52735 878 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KSR2Q6VAB6 950 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MICU3Q86XE3 530 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NR1I2O75469 434 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CABP4P57796 275 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRIM14Q14142 442 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SOGA3Q5TF21 947 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RABGGTAQ92696 567 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZBTB43O43298 467 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 G2E3Q7L622 706 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.97□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ARHGAP25P42331 645 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NPATQ14207 1427 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 LINS1Q8NG48 757 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC114Q96M63 670 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DISP1Q96F81 1524 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 A0A087WZG4 1122 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 HAND2P61296 217 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MLKLQ8NB16 471 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MED4Q9NPJ6 270 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.96□□□□□ -0.01
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ABCC1P33527 1531 aa14.96□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.96□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.96□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ANO1Q5XXA6 986 aa14.96□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CEP57Q86XR8 500 aa14.96□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.96□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 EXOC4Q96A65 974 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NDUFAB1O14561 156 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZNF202O95125 648 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MAP2K2P36507 400 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC96Q2M329 555 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ERVK-7P63135 1459 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 MSL1Q68DK7 614 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ADALQ6DHV7 355 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.95□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 PRC1O43663 620 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 METTL24Q5JXM2 366 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TRIM47Q96LD4 638 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NEFHP12036 1026 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 ACTN2P35609 894 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 AMPD3Q01432 767 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FAM71BQ8TC56 605 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 CFAP58Q5T655 872 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.94□□□□□ -0.02
RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms