RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MLKLQ8NB16 471 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 FERMT2Q96AC1 680 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MADDQ8WXG6 1647 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 H0YHG0 523 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 PSMA7O14818 248 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ATP5DP30049 168 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CUEDC2Q9H467 287 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 KDRP35968 1356 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CEP152O94986 1710 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP100Q494V2 611 aa8.14□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 KRT222Q8N1A0 295 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 STRN4Q9NRL3 753 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CUTAO60888 179 aa8.14□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 USP26Q9BXU7 913 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 USP31Q70CQ4 1352 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CIAO1O76071 339 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 GJB2P29033 226 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF165P49910 485 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.14□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.14□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 GNA14O95837 355 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SDSP20132 328 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SNX16P57768 344 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 FSIP1Q8NA03 581 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 STX10O60499 249 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 ERO1AQ96HE7 468 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 EXOC5O00471 708 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 TIGD1Q96MW7 591 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 ZBTB43O43298 467 aa8.13□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC77Q9BR77 488 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 C6orf50Q9HD87 102 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.13□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CLTCL1P53675 1640 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC175P0C221 793 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 EYA3Q99504 573 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 RAI14Q9P0K7 980 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 KRT86O43790 486 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 ZPR1O75312 459 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 TACC1O75410 805 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.12□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 VAV2P52735 878 aa8.12□□□□□ -1.11
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ALMS1-201ENST00000423048 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MYD88Q99836 296 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 RGL2O15211 777 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SYKP43405 635 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 TRAPPC10P48553 1259 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 TBC1D5Q92609 795 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 KAT14Q9H8E8 782 aa8.12□□□□□ -1.11
ALMS1-201ENST00000423048 PPFIA3O75145 1194 aa8.11□□□□□ -1.11
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