RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 DLL1O00548 723 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 SOX18P35713 384 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 PDE3BQ13370 1112 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 ALX3O95076 343 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 CCDC27Q2M243 656 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 C8orf34Q49A92 452 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 GJD3Q8N144 294 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 MAPK1P28482 360 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 OR13H1Q8NG92 308 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 FAM129BQ96TA1 746 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 NACADO15069 1562 aa6.91□□□□□ -1.3
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TRDN-203ENST00000422596 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 ASB16Q96NS5 453 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 RBSNQ9H1K0 784 aa6.91□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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TRDN-203ENST00000422596 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 TMC1Q8TDI8 760 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 ELP3Q9H9T3 547 aa6.9□□□□□ -1.3
TRDN-203ENST00000422596 ERCC3P19447 782 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ARTNQ5T4W7 220 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 PMEPA1Q969W9 287 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 A6NHS1 94 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 F8W735 103 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 LINC01387J3KSC0 135 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 IGHA2P01877 340 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 HYAL2Q12891 473 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CEP135Q66GS9 1140 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TMC7Q7Z402 723 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 PPME1Q9Y570 386 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TNFRSF21O75509 655 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CDC25BP30305 580 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 PLCB3Q01970 1234 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.86□□□□□ -1.31
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TRDN-203ENST00000422596 KIF4AO95239 1232 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 DSC3Q14574 896 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 SPACA7Q96KW9 195 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CNTN3Q9P232 1028 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 TM4SF5O14894 197 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 GPR182O15218 404 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 WISP1O95388 367 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 COL19A1Q14993 1142 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CEP120Q8N960 986 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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TRDN-203ENST00000422596 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 PHACTR2O75167 634 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 ACPPP15309 386 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CDC27P30260 824 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 PBX4Q9BYU1 374 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-203ENST00000422596 SCRIBQ14160 1630 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-203ENST00000422596 GLB1P16278 677 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-203ENST00000422596 EPHA1P21709 976 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-203ENST00000422596 CES1P23141 567 aa6.83□□□□□ -1.32
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