RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418795.3

FAM27E3-201, Transcript of family with sequence similarity 27 member E3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM27E3, Length 1,593 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3-201ENST00000418795 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 COA1Q9GZY4 146 aa16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 PSME4Q14997 1843 aa16.01■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 GNAI3P08754 354 aa16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 MICALL2Q8IY33 904 aa16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 DPF2Q92785 391 aa16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 CLEC11AQ9Y240 323 aa16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 VGLL2Q8N8G2 317 aa16■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 USP17L3A6NCW0 530 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 USP17L4A6NCW7 530 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 MXD3Q9BW11 206 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 CD209Q9NNX6 404 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 H7C1D1 291 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 EYA2O00167 538 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 EGFRP00533 1210 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 HTRA3P83110 453 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 UBE4AQ14139 1066 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 METTL24Q5JXM2 366 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 DACT2Q5SW24 774 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 GMLQ99445 158 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 PDE8BO95263 885 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 GNAI2P04899 355 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 APLP1P51693 650 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 PANK1Q8TE04 598 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF609O15014 1411 aa15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 MTX1Q13505 466 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 CNTROBQ8N137 903 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 SIL1Q9H173 461 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 PASKQ96RG2 1323 aa15.96■□□□□ 0.15
FAM27E3-201ENST00000418795 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 SRGAP3O43295 1099 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 IL1R1P14778 569 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 GYG1P46976 350 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 GTF2IP78347 998 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FBXW7Q969H0 707 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 COPRSQ9NQ92 184 aa15.96■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 CIAO1O76071 339 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FGFR2P21802 821 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FBXO3Q9UK99 471 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 USP17L8P0C7I0 530 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 JAG2Q9Y219 1238 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 CERS5Q8N5B7 392 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 TRAF5O00463 557 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 SASH1O94885 1247 aa15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 BCAMP50895 628 aa15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 MS4A1P11836 297 aa15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 LPIN2Q92539 896 aa15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 COG6Q9Y2V7 657 aa15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3-201ENST00000418795 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms