RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.33■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 LRRC24Q50LG9 513 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 MEIS3Q99687 375 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 TRIM27P14373 513 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 DLK2Q6UY11 383 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 USP17L3A6NCW0 530 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 USP17L4A6NCW7 530 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 H7C1D1 291 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 DPF2Q92785 391 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 PODNQ7Z5L7 613 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 KLRG1Q96E93 195 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 COA1Q9GZY4 146 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 JAG2Q9Y219 1238 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 DACT2Q5SW24 774 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 GMLQ99445 158 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-205ENST00000417464 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 CREBZFQ9NS37 354 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 GTF2IP78347 998 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 CD209Q9NNX6 404 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 PSME4Q14997 1843 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 METTL24Q5JXM2 366 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 GYG1P46976 350 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 SIL1Q9H173 461 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ZNF609O15014 1411 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ADM5C9JUS6 153 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 USP17L8P0C7I0 530 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 USP48Q86UV5 1035 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 CST9Q5W186 159 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 CERS5Q8N5B7 392 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 GGA3Q9NZ52 723 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-205ENST00000417464 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 RLBP1P12271 317 aa24.19■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 EYA2O00167 538 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 IL1R1P14778 569 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 UBE4AQ14139 1066 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 SCARF1Q14162 830 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 CNTNAP1P78357 1384 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 F8W031 263 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 SASH1O94885 1247 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 PCNTO95613 3336 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 PDE8BO95263 885 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 JMYQ8N9B5 988 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 GNAI3P08754 354 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
UPP1-205ENST00000417464 VEGFBP49765 207 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 FGFR2P21802 821 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 BCAMP50895 628 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 PANK1Q8TE04 598 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-205ENST00000417464 SRGAP3O43295 1099 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms