RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 DGKGP49619 791 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 ORAI2Q96SN7 254 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 CABP1Q9NZU7 370 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 E9PCH4 1651 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 PIK3CDO00329 1044 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 BACH1O14867 736 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 FAM157BP0CG42 384 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 CD33P20138 364 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 EML3Q32P44 896 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 CHSY3Q70JA7 882 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 ZIC5Q96T25 663 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 HCN2Q9UL51 889 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 USP3Q9Y6I4 520 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-210ENST00000415055 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRK-210ENST00000415055 KLF15Q9UIH9 416 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 NOD1Q9Y239 953 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 LAMC1P11047 1609 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 GLI3P10071 1580 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 METP08581 1390 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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PTPRK-210ENST00000415055 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 MYOM2P54296 1465 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-210ENST00000415055 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 FURINP09958 794 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 GTF2IP78347 998 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-210ENST00000415055 CDCA8Q53HL2 280 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 XP32Q5T750 250 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 MARK1Q9P0L2 795 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 FOXO3O43524 673 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 PSME1Q06323 249 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 CD163Q86VB7 1156 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF358Q9NW07 568 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 KIF1BO60333 1816 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 EFSO43281 561 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 ATG7O95352 703 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 TXLNAP40222 546 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 NCOA4Q13772 614 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 TEAD4Q15561 434 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 STRN4Q9NRL3 753 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 ATP9BO43861 1147 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 NOS2P35228 1153 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 CHRNA4P43681 627 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 RGS22Q8NE09 1264 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 ADGRL2O95490 1459 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-210ENST00000415055 USP32Q8NFA0 1604 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-210ENST00000415055 EML1O00423 815 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-210ENST00000415055 ALAS2P22557 587 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-210ENST00000415055 EPHA4P54764 986 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-210ENST00000415055 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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