RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.98■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 SLFN14P0C7P3 912 aa21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.97■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A1B0GVL5 298 aa21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF790Q6PG37 636 aa21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 GCP02774 474 aa21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.96■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.95■■□□□ 1.11
NEFHP1-201ENST00000412845 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 NPHP1O15259 732 aa21.95■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ERO1AQ96HE7 468 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLIM4O00461 696 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 SDF4Q9BRK5 362 aa21.94■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 E7EWF7 191 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 NDUFA8P51970 172 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 KRT222Q8N1A0 295 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 KCND1Q9NSA2 647 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.93■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ATL3Q6DD88 541 aa21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 NEDD4P46934 1319 aa21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 GSDMDP57764 484 aa21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 CLIC4Q9Y696 253 aa21.92■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCC6O95255 1503 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ST7Q9NRC1 585 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 IFNKQ9P0W0 207 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 BIN1O00499 593 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 SMC2O95347 1197 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 TERF2Q15554 542 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ADALQ6DHV7 355 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 TMC6Q7Z403 805 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.91■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A087WZG4 1122 aa21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.9■■□□□ 1.1
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 TIMM10P62072 90 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 PALLDQ8WX93 1383 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 RGPD5Q99666 1765 aa21.89■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.88■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.88■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.88■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 MAST3O60307 1309 aa21.87■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 STK38Q15208 465 aa21.87■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.87■■□□□ 1.09
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A1W2PQ27 194 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms