RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAD9B-204	ENST00000409300	PTH1R	Q03431	593 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	KLRK1	P26718	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	MCC	P23508	829 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	BECN1	Q14457	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RAD50	Q92878	1312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	SRGN	P10124	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	HSPA4	P34932	840 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE6B	P35913	854 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	BBOX1	O75936	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	UTRN	P46939	3433 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	GPSM2	P81274	684 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RABEP1	Q15276	862 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	XDH	P47989	1333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAD9B-204	ENST00000409300	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	MAST3	O60307	1309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300		M0R2C6	588 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	UFL1	O94874	794 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	NPR1	P16066	1061 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	NEK4	P51957	841 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	CHRNA5	P30532	468 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	ANAPC15	P60006	121 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300		H0YIN7	160 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RAD9B-204	ENST00000409300	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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