RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 KRT32Q14532 448 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 RFC4P35249 363 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 MAST3O60307 1309 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 PHKA1P46020 1223 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 PI16Q6UXB8 463 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.221e-6■■■□□ 14.8
USP39-202ENST00000409025 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.66■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 CASZ1Q86V15 1759 aa22.66■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 WASHC4Q2M389 1173 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 FBXO41Q8TF61 875 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 MYH7P12883 1935 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 C4AP0C0L4 1744 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 PHF14O94880 888 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 CHRNDQ07001 517 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-202ENST00000409025 M0R2C6 588 aa22.64■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.64■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 APPBP2Q92624 585 aa22.64■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 OSBP2Q969R2 916 aa22.64■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 NLRP3Q96P20 1036 aa22.64■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ADRA2BP18089 450 aa22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 RPS6KB1P23443 525 aa22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ANKRD1Q15327 319 aa22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 CYP21A2P08686 494 aa22.62■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 PTMSP20962 102 aa22.62■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 PKP1Q13835 747 aa22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 GSE1Q14687 1217 aa22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 NEK1Q96PY6 1258 aa22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 SNAP23O00161 211 aa22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 SPATA5Q8NB90 893 aa22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 COL4A1P02462 1669 aa22.6■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 TRIM37O94972 964 aa22.6■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ADD2P35612 726 aa22.6■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 NPHP1O15259 732 aa22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 UBE3CQ15386 1083 aa22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.59■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.58■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 RASGRF1Q13972 1273 aa22.58■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.58■■□□□ 1.21
USP39-202ENST00000409025 TAF1P21675 1872 aa22.58■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 A0A1B0GUL6 1792 aa22.58■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 TRAK2O60296 914 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 LARGE1O95461 756 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 BCAMP50895 628 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 UBE4AQ14139 1066 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 NFIXQ14938 502 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 ME3Q16798 604 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 GPAA1O43292 621 aa22.55■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 BRD1O95696 1058 aa22.55■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.55■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.55■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 PDE6AP16499 860 aa22.55■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 MAP3K12Q12852 859 aa22.55■■□□□ 1.2
USP39-202ENST00000409025 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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