RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.43■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.43■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.43■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 OLFM4Q6UX06 510 aa24.42■■□□□ 1.5
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ODC1-202ENST00000405333 CHRNA5P30532 468 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 KCNJ4P48050 445 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 GPSM2P81274 684 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 RASGRF1Q13972 1273 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 USP26Q9BXU7 913 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 A0A0D9SFI3 127 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 BBOX1O75936 387 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.41■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.41■■□□□ 1.5
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ODC1-202ENST00000405333 SGSM2O43147 1006 aa24.4■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
ODC1-202ENST00000405333 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
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ODC1-202ENST00000405333 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.39■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.38■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 REC8O95072 547 aa24.38■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.38■■□□□ 1.49
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ODC1-202ENST00000405333 XDHP47989 1333 aa24.38■■□□□ 1.49
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ODC1-202ENST00000405333 H0YIN7 160 aa24.37■■□□□ 1.49
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ODC1-202ENST00000405333 LTBP1Q14766 1721 aa24.36■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.36■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
ODC1-202ENST00000405333 MYH7P12883 1935 aa24.35■■□□□ 1.49
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ODC1-202ENST00000405333 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.33■■□□□ 1.49
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ODC1-202ENST00000405333 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 ILDR2Q71H61 639 aa24.32■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 MTFR1LQ9H019 292 aa24.32■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
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ODC1-202ENST00000405333 STYK1Q6J9G0 422 aa24.31■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.31■■□□□ 1.48
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ODC1-202ENST00000405333 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
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ODC1-202ENST00000405333 TMC4Q7Z404 712 aa24.3■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 JAG2Q9Y219 1238 aa24.3■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 A0A0G2JLW4 131 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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ODC1-202ENST00000405333 PALD1Q9ULE6 856 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 ATP2B4P23634 1241 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 OSBP2Q969R2 916 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.29■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 RAD50Q92878 1312 aa24.28■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 C6orf229H3BNL8 230 aa24.28■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.28■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 M0R2C6 588 aa24.27■■□□□ 1.48
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