RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 XDHP47989 1333 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 H0YIN7 160 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 REC8O95072 547 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB7AO95365 584 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ALDH1B1P30837 517 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 MCAMP43121 646 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 BCAMP50895 628 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 SLC51AQ86UW1 340 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ZAP70P43403 619 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 MYH7P12883 1935 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 GYG1P46976 350 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 PI16Q6UXB8 463 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 TMC4Q7Z404 712 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 VPS37DQ86XT2 251 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 GPSM2P81274 684 aa24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 CHRNA5P30532 468 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 SP8Q8IXZ3 490 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA5Q8NB90 893 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.78■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 SGSM2O43147 1006 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 KLRK1P26718 216 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 RASGRF1Q13972 1273 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 STYK1Q6J9G0 422 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 FAM227BQ96M60 508 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 MTFR1LQ9H019 292 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-204ENST00000402096 POLD1P28340 1107 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 IL25Q9H293 177 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.76■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 UFL1O94874 794 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 GGA1Q9UJY5 639 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 ATP2B4P23634 1241 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 USP26Q9BXU7 913 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 SLX4Q8IY92 1834 aa24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 A0A0D9SFI3 127 aa24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 DOCK2Q92608 1830 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 CNKSR1Q969H4 720 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 RAD50Q92878 1312 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 LTBP1Q14766 1721 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 13.4
ATG4B-204ENST00000402096 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 C6orf229H3BNL8 230 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 CHGBP05060 677 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 TICAM2Q86XR7 235 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-204ENST00000402096 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 OLFM4Q6UX06 510 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 MPNDQ8N594 471 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.7■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 WASHC4Q2M389 1173 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 SEMA3EO15041 775 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 MCCP23508 829 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 POLLQ9UGP5 575 aa24.69■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ATG4B-204ENST00000402096 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms